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BodBoge | 如何解決單細胞測序前的細胞質控?

更新時間:2023-04-04瀏覽:668次

單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(single cell sequencing)是(shi)指(zhi)先分離純化單(dan)個細(xi)胞(bao)(bao),并提取(qu)該細(xi)胞(bao)(bao)的(de)(de)DNA或RNA進行擴增后(hou)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)的(de)(de)技(ji)術。該技(ji)術廣泛(fan)應用于(yu)腫瘤、微生(sheng)物學(xue)、神(shen)經科學(xue)等重要生(sheng)命(ming)科學(xue)領域(yu),單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)技(ji)術也逐漸成為了(le)生(sheng)命(ming)科學(xue)研(yan)究的(de)(de)熱點。相比于(yu)宏觀組織樣(yang)品的(de)(de)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu),單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)對(dui)于(yu)細(xi)胞(bao)(bao)和組織的(de)(de)異質(zhi)性具(ju)有更加明確的(de)(de)分辯,當然,難(nan)度也相對(dui)更高。

單細胞測(ce)序(xu)結合生命科(ke)學研究領域(yu)的(de)應用,已逐(zhu)步向著(zhu)更(geng)高的(de)分辯能(neng)力、靈敏(min)度(du)、和更(geng)多的(de)維度(du)邁進。


什么是單細胞測序?

單細(xi)胞測(ce)序是(shi)基于高通量測(ce)序(NGS)方法(fa),可檢測(ce)單細(xi)胞基因(yin)組、單細(xi)胞轉錄組、單細(xi)胞表觀基因(yin)組,提供細(xi)胞間差(cha)異的(de)高分(fen)辨率(lv)視圖,從分(fen)子(zi)水平揭示(shi)細(xi)胞奧(ao)秘。


樣本要求

01、 樣(yang)本總量

制備成(cheng)單(dan)細(xi)胞(bao)懸浮液(ye),一(yi)個(ge)樣本(ben)的細(xi)胞(bao)起始量需大于1x105


02、 樣(yang)品濃度

最終上樣前細胞濃度在700-1200 cells/μL


03、 細(xi)胞(bao)活性

活細胞比率85%以上


04、  細胞大小(xiao)

直徑小于40μm


其(qi)它要(yao)求

1-細胞培(pei)養(yang)基及緩沖(chong)液(ye)不能(neng)含有Ca2+Mg2+等影響酶活性的物(wu)質。

2-組織(zhi)需解(jie)離成單細胞懸液,植(zhi)物細胞需制成原生質體。



為解決細胞計數準確性(xing)以(yi)及人工復核難的問(wen)題,博大博聚特推(tui)出一(yi)款(kuan)全自(zi)動(dong)熒光(guang)細(xi)胞分析儀(JSY-FL-047"。儀器參照血球計數板計數規則,可實現人工比對儀器的計數結果。具有單(dan)細胞計數模式。為實驗用戶提供更可靠更高效的實驗解決方案。


全自動(dong)熒光細胞分(fen)析儀(JSY-FL-047)

1- 單細胞計數功能

儀器可識別(bie)出樣本中單個細胞所占比(bi)例聚團細(xi)胞所占比例,適合(he)單(dan)細胞測序(xu)前對單(dan)個細胞的質控。


計數結果包含:總細胞數量、總細胞濃度、團(tuan)聚活細胞團(tuan)數(濃度-比率(lv))單(dan)個活細胞數量(濃度-比率)、總死(si)細胞數量(濃度-比率)

 

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